Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epha4Q03137 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Epha4Q03137 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epha4Q03137 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epha4Q03137 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms