Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pax5Q02650 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pax5Q02650 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax5Q02650 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms