Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfcP97953 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfcP97953 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfcP97953 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfcP97953 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfcP97953 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VegfcP97953 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfcP97953 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfcP97953 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfcP97953 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VegfcP97953 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfcP97953 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfcP97953 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfcP97953 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfcP97953 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfcP97953 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfcP97953 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VegfcP97953 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfcP97953 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfcP97953 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfcP97953 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VegfcP97953 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.5 ms