Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
AlkP97793 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
AlkP97793 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
AlkP97793 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
AlkP97793 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
AlkP97793 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
AlkP97793 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
AlkP97793 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
AlkP97793 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
AlkP97793 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
AlkP97793 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
AlkP97793 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
AlkP97793 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
AlkP97793 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
AlkP97793 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
AlkP97793 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
AlkP97793 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
AlkP97793 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
AlkP97793 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
AlkP97793 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
AlkP97793 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
AlkP97793 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
AlkP97793 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
AlkP97793 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
AlkP97793 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
AlkP97793 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
AlkP97793 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
AlkP97793 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
AlkP97793 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
AlkP97793 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
AlkP97793 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
AlkP97793 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
AlkP97793 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
AlkP97793 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
AlkP97793 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
AlkP97793 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
AlkP97793 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
AlkP97793 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
AlkP97793 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
AlkP97793 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
AlkP97793 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
AlkP97793 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
AlkP97793 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
AlkP97793 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
AlkP97793 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
AlkP97793 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
AlkP97793 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
AlkP97793 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
AlkP97793 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
AlkP97793 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
AlkP97793 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
AlkP97793 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
AlkP97793 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
AlkP97793 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
AlkP97793 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
AlkP97793 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
AlkP97793 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
AlkP97793 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
AlkP97793 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
AlkP97793 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
AlkP97793 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
AlkP97793 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
AlkP97793 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
AlkP97793 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
AlkP97793 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
AlkP97793 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
AlkP97793 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
AlkP97793 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
AlkP97793 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
AlkP97793 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
AlkP97793 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
AlkP97793 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
AlkP97793 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
AlkP97793 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
AlkP97793 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
AlkP97793 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
AlkP97793 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
AlkP97793 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
AlkP97793 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
AlkP97793 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
AlkP97793 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
AlkP97793 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
AlkP97793 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
AlkP97793 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
AlkP97793 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
AlkP97793 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
AlkP97793 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC33.81■■■■□ 3
AlkP97793 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AlkP97793 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
AlkP97793 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
AlkP97793 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
AlkP97793 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
AlkP97793 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.78■■■■□ 3
AlkP97793 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AlkP97793 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
AlkP97793 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
AlkP97793 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
AlkP97793 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.77■■■■□ 3
AlkP97793 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
AlkP97793 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms