Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gfra1P97785 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gfra1P97785 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gfra1P97785 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gfra1P97785 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms