Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cry1P97784 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry1P97784 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cry1P97784 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry1P97784 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cry1P97784 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry1P97784 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry1P97784 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cry1P97784 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cry1P97784 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry1P97784 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry1P97784 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry1P97784 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cry1P97784 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cry1P97784 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cry1P97784 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cry1P97784 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms