Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tarbp2P97473 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tarbp2P97473 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tarbp2P97473 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tarbp2P97473 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tarbp2P97473 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms