Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lig3P97386 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig3P97386 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig3P97386 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lig3P97386 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lig3P97386 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lig3P97386 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lig3P97386 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig3P97386 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lig3P97386 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lig3P97386 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lig3P97386 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms