Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RptnP97347 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RptnP97347 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RptnP97347 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RptnP97347 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RptnP97347 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RptnP97347 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RptnP97347 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RptnP97347 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RptnP97347 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RptnP97347 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RptnP97347 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RptnP97347 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RptnP97347 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RptnP97347 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RptnP97347 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RptnP97347 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RptnP97347 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RptnP97347 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RptnP97347 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RptnP97347 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RptnP97347 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RptnP97347 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RptnP97347 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RptnP97347 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RptnP97347 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RptnP97347 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RptnP97347 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RptnP97347 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RptnP97347 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RptnP97347 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RptnP97347 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RptnP97347 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RptnP97347 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RptnP97347 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RptnP97347 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RptnP97347 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RptnP97347 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RptnP97347 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RptnP97347 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RptnP97347 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RptnP97347 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RptnP97347 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RptnP97347 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RptnP97347 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RptnP97347 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RptnP97347 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RptnP97347 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RptnP97347 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RptnP97347 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RptnP97347 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RptnP97347 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RptnP97347 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RptnP97347 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RptnP97347 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RptnP97347 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RptnP97347 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RptnP97347 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RptnP97347 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RptnP97347 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RptnP97347 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RptnP97347 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RptnP97347 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RptnP97347 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RptnP97347 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RptnP97347 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RptnP97347 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RptnP97347 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RptnP97347 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RptnP97347 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RptnP97347 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RptnP97347 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RptnP97347 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RptnP97347 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RptnP97347 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RptnP97347 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RptnP97347 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RptnP97347 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RptnP97347 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RptnP97347 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RptnP97347 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RptnP97347 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RptnP97347 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RptnP97347 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RptnP97347 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RptnP97347 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RptnP97347 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RptnP97347 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RptnP97347 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RptnP97347 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RptnP97347 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RptnP97347 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RptnP97347 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RptnP97347 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RptnP97347 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RptnP97347 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RptnP97347 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RptnP97347 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RptnP97347 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RptnP97347 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms