Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Irx2P81066 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx2P81066 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Irx2P81066 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Irx2P81066 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx2P81066 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irx2P81066 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx2P81066 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irx2P81066 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx2P81066 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx2P81066 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Irx2P81066 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irx2P81066 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms