Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CiitaP79621 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CiitaP79621 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CiitaP79621 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CiitaP79621 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CiitaP79621 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CiitaP79621 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CiitaP79621 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CiitaP79621 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CiitaP79621 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CiitaP79621 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CiitaP79621 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CiitaP79621 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CiitaP79621 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CiitaP79621 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CiitaP79621 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CiitaP79621 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CiitaP79621 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms