Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbx6P70327 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tbx6P70327 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tbx6P70327 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tbx6P70327 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms