Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tgif1P70284 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tgif1P70284 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tgif1P70284 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Tgif1P70284 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tgif1P70284 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms