Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Depdc5P61460 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Depdc5P61460 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Depdc5P61460 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Depdc5P61460 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35.45■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Depdc5P61460 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Depdc5P61460 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Depdc5P61460 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Depdc5P61460 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Depdc5P61460 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Depdc5P61460 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Depdc5P61460 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Depdc5P61460 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Depdc5P61460 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Depdc5P61460 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms