Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf13P61216 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf13P61216 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf13P61216 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf13P61216 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf13P61216 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf13P61216 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Taf13P61216 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf13P61216 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf13P61216 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf13P61216 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf13P61216 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf13P61216 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf13P61216 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf13P61216 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf13P61216 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms