Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cyp2c40P56657 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cyp2c40P56657 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cyp2c40P56657 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cyp2c40P56657 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cyp2c40P56657 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cyp2c40P56657 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cyp2c40P56657 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms