Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcnfP51944 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcnfP51944 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CcnfP51944 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CcnfP51944 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CcnfP51944 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CcnfP51944 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcnfP51944 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcnfP51944 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcnfP51944 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcnfP51944 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CcnfP51944 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnfP51944 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnfP51944 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CcnfP51944 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcnfP51944 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcnfP51944 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcnfP51944 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CcnfP51944 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CcnfP51944 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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