Protein–RNA interactions for Protein: P51791

Clcn3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn3P51791 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcn3P51791 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clcn3P51791 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clcn3P51791 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn3P51791 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clcn3P51791 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clcn3P51791 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcn3P51791 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcn3P51791 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clcn3P51791 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms