Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccr1P51675 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccr1P51675 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccr1P51675 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccr1P51675 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccr1P51675 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms