Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnni3P48787 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnni3P48787 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tnni3P48787 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnni3P48787 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnni3P48787 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnni3P48787 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms