Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Brca1P48754 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Brca1P48754 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brca1P48754 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Brca1P48754 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brca1P48754 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brca1P48754 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Brca1P48754 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Brca1P48754 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brca1P48754 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brca1P48754 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brca1P48754 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Brca1P48754 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brca1P48754 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brca1P48754 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brca1P48754 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brca1P48754 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brca1P48754 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brca1P48754 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brca1P48754 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Brca1P48754 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brca1P48754 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brca1P48754 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brca1P48754 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brca1P48754 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca1P48754 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca1P48754 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca1P48754 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca1P48754 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brca1P48754 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms