Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LmnaP48678 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LmnaP48678 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LmnaP48678 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LmnaP48678 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LmnaP48678 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LmnaP48678 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LmnaP48678 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LmnaP48678 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LmnaP48678 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LmnaP48678 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LmnaP48678 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LmnaP48678 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LmnaP48678 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LmnaP48678 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LmnaP48678 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LmnaP48678 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LmnaP48678 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LmnaP48678 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LmnaP48678 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LmnaP48678 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LmnaP48678 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms