Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prox1P48437 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prox1P48437 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prox1P48437 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prox1P48437 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox1P48437 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prox1P48437 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prox1P48437 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prox1P48437 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prox1P48437 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prox1P48437 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prox1P48437 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prox1P48437 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prox1P48437 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prox1P48437 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prox1P48437 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prox1P48437 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prox1P48437 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms