Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klf1P46099 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Klf1P46099 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klf1P46099 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klf1P46099 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klf1P46099 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klf1P46099 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klf1P46099 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klf1P46099 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klf1P46099 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klf1P46099 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klf1P46099 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klf1P46099 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klf1P46099 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Klf1P46099 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klf1P46099 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klf1P46099 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klf1P46099 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Klf1P46099 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Klf1P46099 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klf1P46099 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klf1P46099 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klf1P46099 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klf1P46099 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klf1P46099 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klf1P46099 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klf1P46099 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klf1P46099 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klf1P46099 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klf1P46099 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klf1P46099 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms