Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxc11P31313 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxc11P31313 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxc11P31313 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxc11P31313 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms