Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hoxa10P31310 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa10P31310 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa10P31310 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa10P31310 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms