Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa2P31245 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa2P31245 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa2P31245 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxa2P31245 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa2P31245 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms