Protein–RNA interactions for Protein: P30275

Ckmt1, Creatine kinase U-type, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckmt1P30275 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ckmt1P30275 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ckmt1P30275 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ckmt1P30275 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ckmt1P30275 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ckmt1P30275 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms