Protein–RNA interactions for Protein: P28651

Ca8, Carbonic anhydrase-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca8P28651 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ca8P28651 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ca8P28651 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ca8P28651 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ca8P28651 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ca8P28651 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ca8P28651 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ca8P28651 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ca8P28651 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ca8P28651 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ca8P28651 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ca8P28651 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ca8P28651 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ca8P28651 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ca8P28651 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ca8P28651 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ca8P28651 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ca8P28651 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ca8P28651 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ca8P28651 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ca8P28651 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ca8P28651 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ca8P28651 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ca8P28651 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ca8P28651 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1227.9 ms