Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Slc6a9P28571 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc6a9P28571 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc6a9P28571 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Slc6a9P28571 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc6a9P28571 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc6a9P28571 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc6a9P28571 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc6a9P28571 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc6a9P28571 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc6a9P28571 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc6a9P28571 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc6a9P28571 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc6a9P28571 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Slc6a9P28571 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms