Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dusp1P28563 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Dusp1P28563 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dusp1P28563 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dusp1P28563 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Dusp1P28563 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dusp1P28563 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dusp1P28563 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dusp1P28563 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dusp1P28563 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Dusp1P28563 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dusp1P28563 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Dusp1P28563 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Dusp1P28563 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms