Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NdnP25233 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NdnP25233 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NdnP25233 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NdnP25233 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NdnP25233 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NdnP25233 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NdnP25233 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NdnP25233 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NdnP25233 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NdnP25233 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NdnP25233 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NdnP25233 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NdnP25233 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NdnP25233 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NdnP25233 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NdnP25233 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NdnP25233 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NdnP25233 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NdnP25233 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NdnP25233 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NdnP25233 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NdnP25233 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NdnP25233 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NdnP25233 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NdnP25233 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NdnP25233 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NdnP25233 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NdnP25233 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NdnP25233 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NdnP25233 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NdnP25233 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NdnP25233 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NdnP25233 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NdnP25233 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NdnP25233 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NdnP25233 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NdnP25233 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NdnP25233 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NdnP25233 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NdnP25233 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NdnP25233 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NdnP25233 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NdnP25233 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NdnP25233 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NdnP25233 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NdnP25233 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NdnP25233 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NdnP25233 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NdnP25233 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NdnP25233 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NdnP25233 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NdnP25233 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NdnP25233 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NdnP25233 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NdnP25233 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NdnP25233 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NdnP25233 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NdnP25233 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NdnP25233 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NdnP25233 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NdnP25233 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NdnP25233 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NdnP25233 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NdnP25233 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NdnP25233 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NdnP25233 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NdnP25233 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NdnP25233 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NdnP25233 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NdnP25233 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NdnP25233 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NdnP25233 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NdnP25233 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NdnP25233 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NdnP25233 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NdnP25233 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NdnP25233 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NdnP25233 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NdnP25233 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NdnP25233 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NdnP25233 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NdnP25233 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NdnP25233 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NdnP25233 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NdnP25233 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NdnP25233 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NdnP25233 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NdnP25233 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NdnP25233 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NdnP25233 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NdnP25233 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NdnP25233 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NdnP25233 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NdnP25233 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NdnP25233 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NdnP25233 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NdnP25233 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NdnP25233 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NdnP25233 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms