Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxd11P23813 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hoxd11P23813 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxd11P23813 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hoxd11P23813 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxd11P23813 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Hoxd11P23813 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Hoxd11P23813 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
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