Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pde6bP23440 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde6bP23440 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6bP23440 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6bP23440 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde6bP23440 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pde6bP23440 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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