Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cox4i1P19783 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cox4i1P19783 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cox4i1P19783 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cox4i1P19783 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cox4i1P19783 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cox4i1P19783 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cox4i1P19783 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cox4i1P19783 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cox4i1P19783 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms