Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fgf4P11403 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fgf4P11403 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf4P11403 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf4P11403 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms