Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sub1P11031 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sub1P11031 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sub1P11031 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sub1P11031 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sub1P11031 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sub1P11031 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sub1P11031 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sub1P11031 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sub1P11031 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms