Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd4P10628 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxd4P10628 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd4P10628 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd4P10628 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms