Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Amd1P0DMN7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Amd1P0DMN7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Amd1P0DMN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Amd1P0DMN7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Amd1P0DMN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Amd1P0DMN7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Amd1P0DMN7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Amd1P0DMN7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Amd1P0DMN7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Amd1P0DMN7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms