Protein–RNA interactions for Protein: P09240

Cck, Cholecystokinin, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckP09240 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckP09240 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckP09240 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckP09240 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckP09240 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckP09240 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CckP09240 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckP09240 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckP09240 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckP09240 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CckP09240 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckP09240 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckP09240 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckP09240 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CckP09240 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckP09240 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckP09240 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckP09240 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckP09240 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckP09240 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CckP09240 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckP09240 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckP09240 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CckP09240 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckP09240 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckP09240 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckP09240 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CckP09240 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckP09240 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckP09240 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckP09240 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckP09240 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckP09240 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckP09240 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CckP09240 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckP09240 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckP09240 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckP09240 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckP09240 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckP09240 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckP09240 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckP09240 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckP09240 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckP09240 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckP09240 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckP09240 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckP09240 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CckP09240 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckP09240 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckP09240 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckP09240 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckP09240 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckP09240 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckP09240 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CckP09240 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckP09240 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckP09240 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckP09240 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckP09240 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckP09240 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckP09240 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckP09240 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckP09240 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckP09240 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckP09240 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckP09240 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckP09240 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CckP09240 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckP09240 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CckP09240 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckP09240 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckP09240 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckP09240 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckP09240 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckP09240 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckP09240 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckP09240 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckP09240 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckP09240 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CckP09240 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckP09240 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CckP09240 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckP09240 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckP09240 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckP09240 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckP09240 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckP09240 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckP09240 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CckP09240 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckP09240 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckP09240 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckP09240 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckP09240 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckP09240 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckP09240 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CckP09240 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CckP09240 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckP09240 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckP09240 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CckP09240 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms