Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa5P09021 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa5P09021 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa5P09021 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxa5P09021 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms