Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LtkP08923 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LtkP08923 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LtkP08923 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LtkP08923 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LtkP08923 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LtkP08923 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LtkP08923 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LtkP08923 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LtkP08923 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LtkP08923 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LtkP08923 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LtkP08923 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LtkP08923 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LtkP08923 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LtkP08923 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LtkP08923 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LtkP08923 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LtkP08923 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LtkP08923 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LtkP08923 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LtkP08923 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LtkP08923 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LtkP08923 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LtkP08923 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LtkP08923 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LtkP08923 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LtkP08923 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LtkP08923 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LtkP08923 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LtkP08923 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LtkP08923 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LtkP08923 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LtkP08923 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LtkP08923 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LtkP08923 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LtkP08923 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LtkP08923 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LtkP08923 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LtkP08923 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LtkP08923 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LtkP08923 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LtkP08923 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LtkP08923 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LtkP08923 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LtkP08923 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LtkP08923 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LtkP08923 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LtkP08923 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LtkP08923 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LtkP08923 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LtkP08923 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LtkP08923 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LtkP08923 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LtkP08923 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LtkP08923 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LtkP08923 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LtkP08923 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LtkP08923 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LtkP08923 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LtkP08923 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LtkP08923 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LtkP08923 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LtkP08923 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LtkP08923 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LtkP08923 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LtkP08923 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LtkP08923 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LtkP08923 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LtkP08923 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LtkP08923 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LtkP08923 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LtkP08923 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LtkP08923 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LtkP08923 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtkP08923 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtkP08923 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtkP08923 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtkP08923 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtkP08923 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtkP08923 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LtkP08923 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LtkP08923 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LtkP08923 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LtkP08923 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LtkP08923 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LtkP08923 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LtkP08923 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LtkP08923 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LtkP08923 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LtkP08923 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LtkP08923 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LtkP08923 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LtkP08923 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LtkP08923 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LtkP08923 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LtkP08923 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LtkP08923 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LtkP08923 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LtkP08923 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms