Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spta1P08032 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spta1P08032 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Spta1P08032 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Spta1P08032 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Spta1P08032 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spta1P08032 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Spta1P08032 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spta1P08032 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spta1P08032 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spta1P08032 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spta1P08032 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spta1P08032 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spta1P08032 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Spta1P08032 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Spta1P08032 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spta1P08032 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spta1P08032 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Spta1P08032 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spta1P08032 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Spta1P08032 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Spta1P08032 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Spta1P08032 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spta1P08032 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spta1P08032 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spta1P08032 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spta1P08032 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Spta1P08032 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Spta1P08032 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spta1P08032 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spta1P08032 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Spta1P08032 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spta1P08032 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spta1P08032 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Spta1P08032 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spta1P08032 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spta1P08032 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spta1P08032 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms