Protein–RNA interactions for Protein: P01794

Ig heavy chain V region HPCG14, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01794 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01794 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01794 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01794 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01794 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01794 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01794 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01794 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01794 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01794 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01794 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01794 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01794 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01794 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01794 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01794 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01794 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01794 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01794 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01794 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01794 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01794 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01794 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01794 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01794 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01794 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01794 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01794 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01794 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01794 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01794 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01794 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01794 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01794 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01794 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01794 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01794 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01794 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01794 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01794 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01794 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01794 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01794 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01794 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01794 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01794 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01794 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01794 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01794 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01794 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01794 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01794 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01794 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01794 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01794 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01794 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01794 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01794 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01794 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01794 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01794 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01794 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01794 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01794 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01794 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01794 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01794 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01794 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01794 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01794 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01794 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01794 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01794 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01794 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01794 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01794 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01794 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01794 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01794 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01794 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01794 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01794 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01794 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01794 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01794 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01794 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01794 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01794 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01794 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms