Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odc1P00860 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odc1P00860 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Odc1P00860 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odc1P00860 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odc1P00860 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odc1P00860 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Odc1P00860 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Odc1P00860 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Odc1P00860 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Odc1P00860 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Odc1P00860 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Odc1P00860 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odc1P00860 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odc1P00860 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Odc1P00860 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Odc1P00860 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms