Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl6O88848 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl6O88848 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl6O88848 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl6O88848 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl6O88848 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl6O88848 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl6O88848 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl6O88848 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl6O88848 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl6O88848 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl6O88848 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6O88848 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6O88848 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6O88848 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arl6O88848 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6O88848 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arl6O88848 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms