Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClppO88696 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClppO88696 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClppO88696 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClppO88696 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClppO88696 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClppO88696 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClppO88696 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClppO88696 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClppO88696 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClppO88696 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClppO88696 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClppO88696 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClppO88696 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClppO88696 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClppO88696 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClppO88696 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClppO88696 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClppO88696 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ClppO88696 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClppO88696 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClppO88696 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClppO88696 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ClppO88696 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClppO88696 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClppO88696 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClppO88696 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClppO88696 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ClppO88696 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClppO88696 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClppO88696 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClppO88696 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClppO88696 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClppO88696 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClppO88696 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClppO88696 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClppO88696 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ClppO88696 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClppO88696 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClppO88696 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClppO88696 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ClppO88696 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ClppO88696 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClppO88696 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ClppO88696 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClppO88696 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClppO88696 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClppO88696 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClppO88696 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClppO88696 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClppO88696 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ClppO88696 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClppO88696 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClppO88696 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClppO88696 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClppO88696 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClppO88696 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClppO88696 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClppO88696 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClppO88696 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClppO88696 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClppO88696 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClppO88696 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClppO88696 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClppO88696 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClppO88696 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ClppO88696 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClppO88696 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClppO88696 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ClppO88696 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClppO88696 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClppO88696 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClppO88696 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClppO88696 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClppO88696 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClppO88696 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClppO88696 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClppO88696 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClppO88696 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClppO88696 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClppO88696 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClppO88696 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClppO88696 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClppO88696 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClppO88696 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClppO88696 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClppO88696 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClppO88696 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClppO88696 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClppO88696 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClppO88696 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClppO88696 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClppO88696 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClppO88696 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClppO88696 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClppO88696 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClppO88696 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClppO88696 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClppO88696 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClppO88696 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms