Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ComtO88587 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ComtO88587 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ComtO88587 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ComtO88587 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ComtO88587 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ComtO88587 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ComtO88587 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ComtO88587 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ComtO88587 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ComtO88587 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ComtO88587 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ComtO88587 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ComtO88587 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ComtO88587 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ComtO88587 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ComtO88587 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ComtO88587 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ComtO88587 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ComtO88587 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ComtO88587 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ComtO88587 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ComtO88587 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ComtO88587 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ComtO88587 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ComtO88587 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ComtO88587 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ComtO88587 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ComtO88587 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ComtO88587 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ComtO88587 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ComtO88587 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ComtO88587 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ComtO88587 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ComtO88587 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ComtO88587 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ComtO88587 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ComtO88587 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ComtO88587 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ComtO88587 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ComtO88587 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ComtO88587 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ComtO88587 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ComtO88587 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ComtO88587 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ComtO88587 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ComtO88587 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ComtO88587 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ComtO88587 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ComtO88587 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ComtO88587 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ComtO88587 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ComtO88587 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ComtO88587 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ComtO88587 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ComtO88587 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ComtO88587 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ComtO88587 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ComtO88587 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ComtO88587 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ComtO88587 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ComtO88587 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ComtO88587 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ComtO88587 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ComtO88587 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ComtO88587 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ComtO88587 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ComtO88587 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ComtO88587 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ComtO88587 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ComtO88587 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ComtO88587 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ComtO88587 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ComtO88587 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ComtO88587 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ComtO88587 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ComtO88587 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ComtO88587 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ComtO88587 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ComtO88587 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ComtO88587 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ComtO88587 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ComtO88587 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ComtO88587 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ComtO88587 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ComtO88587 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ComtO88587 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms