Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rad51dO55230 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rad51dO55230 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rad51dO55230 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rad51dO55230 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms