Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tnk2O54967 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnk2O54967 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnk2O54967 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnk2O54967 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnk2O54967 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms